期刊简介
中华医学会、中国医学科学院生物医学工程所主办。本刊专门报导国内外生物医学工程学科领域的新技术、新进展、新动向与新成果，促进国际生物医学工程学科的学术交流。本刊不仅全面、及时地介绍和跟踪了国际生物医学工程的研究进展与趋势，也反映了我国生物医学工程学科的研究动向和关注热点。读者对象是生物医学工程科研工作者、医生和临床工程人员、高等院校有关专业师生及研究生等。主要栏目设有专家论坛、综述、论著、研究简报、新技术介绍及消息等。本刊为中文核心期刊(北京大学图书馆)及中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)。
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首页>国际生物医学工程杂志
- 杂志名称：国际生物医学工程杂志
- 主管单位：中华人民共和国卫生部
- 主办单位：中华医学会;中国医学科学院生物医学工程研究所
- 国际刊号：1673-4181
- 国内刊号：12-1382/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：在首届《CAJ－CD规范》执行评优活动中荣获《CAJ－CD规范》执行优秀奖期刊收录：国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中)
基于生物信息学筛选乳腺癌放疗抵抗相关微小RNA的研究
朱长春；冯国兴；樊赛军
关键词：乳腺癌, 生物信息学, 微小RNA, 放疗抵抗
摘要：目的 筛选乳腺癌放射治疗(放疗)抵抗相关微小RNA(miRNAs),为乳腺癌患者放疗抵抗的基础研究与临床应用研究提供实验基础.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载乳腺癌放疗患者相关miRNAs微阵列数据集GSE 107743,利用GEO2R分析工具筛选放疗后局部复发患者的差异表达miRNAs,mirDIP数据库预测差异表达miRNAs的靶基因,DAVID数据库对靶基因分别进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.后采用实时荧光定量PCR在人乳腺癌细胞MCF-7中进行差异表达验证.结果 采用GEO2R分析工具筛选出9种与放疗抵抗相关的差异表达miRNAs,其中3种miRNAs(hsa-miR-600、hsa-miR-525-3p、hsa-miR-591)表达上调,6种miRNAs(hsa-miR-488-5p、hsa-miR-582-3p、hsa-miR-520h、hsa-miR-488-3p、hsa-miR-744-3p、hsa-miR-103b)表达下调.靶基因预测结果显示,9种差异表达miRNAs的潜在靶基因共134个.靶基因显著富集在细胞周期、细胞凋亡、干细胞分化等相关生物学过程(均P＜0.05)以及转化生长因子-β、磷脂酰肌醇3-激酶蛋白激酶B信号通路等信号通路中(均P＜0.05).实时荧光定量PCR检测结果表明,6种miRNAs (hsa-miR-600、hsa-miR-525-3p、hsa-miR-591、hsa-miR488-5p、hsa-miR-582-3p、hsa-miR-520h)在经5 Gy 137Csγ射线辐照后的MCF-7细胞中表达差异改变与GEO2R分析结果完全一致.结论 利用生物信息学从乳腺癌放疗患者局部复发临床样本中筛选出的差异表达miRNAs可能与乳腺癌患者的放疗抵抗密切相关,有望成为放疗抵抗治疗的新靶点.
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